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아스트라제네카 분자구조를 그래프로..

코로나19 로 인해 대부분의 사람들이 백신을 맞았을 것입니다. 그 백신 중 하나로 아스트라제네카가 있죠. 펍켐에 등록된 AstraZeneca compound 1 를 찾아보니 이 화합물의 이름은 4-({5-Bromo-4-[(4-methoxyphenyl)amino]pyrimidin-2-yl}amino)benzoic acid 으로 나옵니다. 이 화합물에 대한 스마일스코드를 취득하여 그래프 형태로 나타내보면 어떨까요.. 우선 분자식은 위 그림과 같습니다. 그래프 형태로 바꾸면 좀 더 다이나믹하게 살펴볼 수 있겠군요.

N:::만지작 거리기 2022. 6. 24. 17:13
Netwokx를 활용하여 분자구조 그리기

파이썬, 그래프 라이브러리를 활용하여 네트워크 그리기 기본 이해NetworkX는 그래프와 네트워크를 연구하기위한 Python 라이브러리로서, BSD-new 라이센스에 따라 공개 된 무료 소프트웨어이다.이 라이브러리를 통해 그래프를 그려볼 것이다.공식 홈페이지는 아래와 같다.https://networkx.org/ RDKit은 RDKit은 C++ 및 Python으로 작성된 화학 정보학 및 기계 학습 소프트웨어 모음이다. 이를 활용하여 화학물질을 다룰 수 있다.공식 홈페이지는 아래와 같다.https://www.rdkit.org/ SMILES 코드는 분자구조 화학식을 문자열로 변환하는 방법 중에 하나로 원자들의 화학 결합을 표현할 수 있다.위키백과에 따르면  ASCII 문자열을 사용하여 화학종의 구조를 설명하기..

N:::만지작 거리기 2022. 2. 15. 22:58
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